เทศบาลเมืองบ้านพรุ มีเส้นทางคมนาคมหลัก ๆ ติดต่อกับอำเภอใกล้เคียง ได้แก่
ถนนกาญจนวนิช หรือ ทางหลวงแผ่นดินหมายเลข 4 เป็นเส้นทางสายหลักที่มุ่งสู่ภาคใต้ของประเทศไทย โดยในอดีตเคยใช้ชื่อเรียกช่วงเริ่มต้นว่าทางกรุงเทพฯ – คลองพรวน ก่อนจะเปลี่ยนชื่อเป็นถนนเพชรเกษม ในเวลาต่อมา และในปัจจุบันยังใช้เรียกช่วงเส้นทางสำคัญในจังหวัด ได้แก่ บางส่วนในสงขลา เช่น ช่วงหาดใหญ่ – สะเดา หรือหาดใหญ่ – สงขลา (เดิมคือ ทล.407) ปัจจุบันถูกผนวกและเรียกขานในนามถนนกาญจนวนิช (หรือกาญจนวณิชย์) สิ้นสุดที่จุดผ่านแดนถาวรสะเดา อำเภอสะเดา จังหวัดสงขลา (ชายแดนไทย – มาเลเซีย)
ถนนเอเชีย หรือ ทางหลวงแผ่นดินหมายเลข 43 (บ้านคูหา – จะนะ) เป็นถนนที่ผ่านทางทิศเหนือสุดของเขตเทศบาลเป็นเส้นแบ่งเขตระหว่างเทศบาลเมืองบ้านพรุกับเทศบาลเมืองคอหงส์
ถนนสายโปะหมอ – บ้านท่าหรั่ง (ถนนบ้านพรุธานี) เป็นถนนที่เชื่อมเขตเทศบาลเมืองบ้านพรุกับเขตอำเภอคลองหอยโข่งซึ่งสามารถใช้เป็นทางลัดไปสู่สนามบินนานาชาติหาดใหญ่ได้อีกเส้นทางหนึ่ง
ถนนสราญราษฎร์ – ถนนพลพิชัย เป็นถนนที่เชื่อมเขตเทศบาลเมืองบ้านพรุกับเทศบาลเมืองคอหงส์ และเทศบาลนครหาดใหญ่ ใช้เป็นเส้นทางลัดผ่านมหาวิทยาลัยหาดใหญ่ และเทศบาลนครหาดใหญ่
ด้านการพัฒนาระบบคมนาคมและโลจิสติกส์
การพัฒนาระบบคมนาคมและโลจิสติกส์ในเขตเทศบาลเมืองบ้านพรุ มุ่งเน้นการขยายผิวจราจรและปรับปรุงโครงสร้างพื้นฐานถนนสายหลักและถนนในชุมชน เช่น โครงการขยายถนนคอนกรีตเสริมเหล็กถนน บ้านพรุธานี เพื่อเชื่อมต่อการเดินทางและการขนส่งสินค้าในพื้นที่เศรษฐกิจรอบนอกหาดใหญ่ให้คล่องตัว ปลอดภัย
ด้านการคมนาคมทางอากาศ
พื้นที่เทศบาลเมืองบ้านพรุ ไม่มีสนามบินหรือการตั้งอยู่ในเขตพื้นที่การบินโดยตรง แต่มีการเชื่อมต่อกับระบบคมนาคมทางอากาศผ่านโครงข่ายถนนสายเลี่ยงเมืองและการเดินทางไปยังท่าอากาศยานใกล้เคียง ได้แก่ โครงการถนนเลี่ยงเมืองหาดใหญ่ (ด้านตะวันออก) ช่วงบ้านพรุ–สนามบิน และบริการรถรับส่งเข้าสู่ท่าอากาศยานหาดใหญ่ การเชื่อมโยงเส้นทางและโครงสร้างพื้นฐานโครงการถนนเลี่ยงเมืองหาดใหญ่ (ด้านตะวันออก) : ช่วงบ้านพรุ – ทางเข้าสนามบินหาดใหญ่ (ระหว่าง กม. 31 – กม. 33+426) ระยะทางประมาณ 7.183 กิโลเมตร ด้วยงบประมาณก่อสร้าง 570 ล้านบาท เพื่อช่วยร่นระยะเวลาและอำนวยความสะดวกในการเดินทางขนส่งจากพื้นที่บ้านพรุเชื่อมตรงสู่สนามบินระยะห่างและการเดินทาง : พื้นที่เทศบาลเมืองบ้านพรุอยู่ใกล้กับท่าอากาศยานหาดใหญ่ (HDY) โดยใช้เวลาเดินทางผ่านทางหลวงและถนนสายหลักในอำเภอหาดใหญ่ประมาณ 20–30 นาที (ระยะทางราว 15–20 กิโลเมตร)
ด้านการขนส่งสาธารณะ
พื้นที่เทศบาลเมืองบ้านพรุหลัก ๆ ใช้ระบบถนนเป็นโครงข่ายเชื่อมต่อโดยมีเส้นทางคมนาคมสายประธานได้แก่ ถนนกาญจนวนิช (ทางหลวงแผ่นดินหมายเลข 4) และถนนสายเอเชีย (ทางหลวงแผ่นดินหมายเลข 43) ซึ่งเชื่อมโยงการเดินทางเข้าสู่อำเภอหาดใหญ่และพื้นที่ใกล้เคียง